Neben der ersten Mannschaft bietet Pfadi auf allen Nachwuchsstufen ein professionell organisiertes Angebot. Die Nachwuchsbewegung von Pfadi ist eine der besten in der Schweiz. Mehrere Schweizermeister-Titel der U17 bis U19-Mannschaften dokumentieren diese hervorragende Nachwuchsarbeit. Die Integration der eigenen Nachwuchstalente in die Leistungsmannschaft geniesst einen hohen Stellenwert. Pfadi betreibt auch eine Breitensport-Abteilung.
Pfadi Winterthur gliedert sich in zwei Vereine:
- Pfadi Winterthur Handball
- Pfadi Winterthur Marketing & Management